Program Pascasarjana Ilmu Manajemen mulai diselenggarakan pada tahun 1993 melalui keputusan Direktur Jendral Pendidikan Tinggi, Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia No. 577/DIKTI/Kep/1993. Pada awal berdirinya, proses belajar mengajar dilakukan di kampus Universitas Indonesia yang terletak di Salemba. Dengan berkembangnya jumlah mahasiswa dan terbatasnya ruang gerak di Kampus Salemba, sejak 7 Juni 1997 Program Pascasarjana Ilmu Manajemen pindah ke Kampus Universitas Indonesia yang terletak di Depok. Lokasi Program Studi yang berada di Depok memungkinkan kemudahan akses untuk fasilitas bersama seperti fasilitas ruang perkuliahan dan fasilitas penunjang kegiatan lainnya seperti akses perpustakaan, laboratorium komputer, dan jaringan intranet UI.
Awalnya, Program Pascasarjana Ilmu Manajemen (PPIM) tidak memiliki kekhususan. Namun dengan berkembangnya sektor keuangan Indonesia, PPIM membangun fokus pada Ilmu Keuangan. Selanjutnya, untuk memenuhi kebutuhan pasar dalam pengembangan keilmuan, mulai tahun ajaran 1997/1998, PPIM membuka satu kekhususan lagi, yaitu kekhususan Pemasaran. Dalam evolusinya, sejak tahun 2020 Program S3 PPIM menawarkan kekhususan Keuangan dan Perbankan, Pemasaran, dan Stratejik. Sementara pada Program S2 PPIM terdapat empat peminatan yaitu, Finance and Banking, Digital Marketing and Analytics, Strategic Management, dan Human Capital Management. Selain itu, saat ini PPIM juga menawarkan program gelar ganda melalui kerjasama dengan University of Melbourne pada program Master of International Business.